KOD SYBR® qPCR Mix

用途

Realtime PCR

说明

KOD SYBR® qPCR Mix是使用KOD DNA polymerase(KOD)的SYBR® GreenⅠ检测体系进行荧光定量PCR的Master mix。由于KOD SYBR qPCR Mix是去除了3’→5’核酸外切酶活性(校正活性)的KOD exo(−)DNA polymerase和最适化buffer的组合、最大程度发挥了KOD的『高效合成能力』以及『不易受到粗样品的抑制』的特性,可稳定地用于各种用途的荧光定量PCR。 

引物的Tm值以及扩增产物的Tm值计算

特征

对GC含量高的目的片段很有效

对于GC含量70%以上,用以往产品难以扩增的目的片段,也可定量扩增。


图2. GC含量不均一的启动子区域的Realtime PCR(使用ABI StepOnePlusTM)
已确认本试剂对易于形成二级结构的目的片段也能有效扩增。

可扩增长链目的片段(〜2kb)
KOD FX以及KOD-Plus-系列等通常用于PCR的引物可直接使用。由于长链目的片段也可扩增,扩大了引物的选择范围。

2kb以内的各种长度目的片段均可选择,因此可在大范围内进行融解曲线分析。可以选择引物二聚体的产生范围以外的扩增区域(短链区域),对于用end point法进行的多重分析、multiplex PCR有很好的效果。

适用于粗样品的分析
用植物裂解液、鼠尾碱裂解液等粗样品可直接检测。运用SYBR®Green Ⅰ检测法,能简化繁琐复杂的多型分析及SNP分析。
①扩增长度不同的基因分型检测
通过改变两种扩增产物的扩增长度,只需引物的Tm值设计成不同,即可在单管中进行mouse tail的基因分型。(参照上一个特征)。


图6.从血液及口腔粘膜的检测(用ABI 7500 Fast)
(A) 表示ALDH2 SNP检测用引物。为了能在一管中进行基因型的分辨,引物设计时,在一条等位基因特异的引物上加了GC tail (下划线部分),使扩增产物的融解温度(Tm值)产生差异。GC tail的添加使得融解温度大幅度上升,使用扩增长度在100bp以下。另外,该实验例中,将等位基因特异的引物3’端开始第2位碱基设为SNP位点(红色)、第3位碱基设计了错配(绿色)位点。
(B) 向20μl反应体系中添加5μl血液的稀释液或口腔粘膜的悬浊液,进行检测。结果显示,可以判定基因型。

③使用粗样品进行检测
对于用以往使用Taq DNA polymerase的PCR试剂难以扩增的粗样品也可以进行检测分析。



高特异性
通过抑制引物二聚体等非特异性反应,在低拷贝区域也可进行广泛的定量检测。同时通过使用本公司荧光定量PCR用cDNA合成试剂盒「ReverTra Ace® qPCR RT系列」,可以进行稳定的检测。


适用于各种仪器
除了模块型仪器(也适用于Fast Mode),也适用于使用毛细管的高速循环仪。另外,由于另附了50×ROX reference dye,对需要passive reference的仪器也可以使用,适用于各种仪器的ROX浓度。
  【可以使用的仪器例】

仪器

 ROX最终浓度(添加量)

 Applied Biosystems 7000、7300、7700、7900HT、StepOne™、 StepOnePlus™

 1×(1/50量)

 Applied Biosystems 7500、7500Fast、 Agilent Technologies Mx3000P、Mx3005P、Mx4000

 0.1×(1/500量)

 Roche公司仪器(LightCycler® 2.0、LightCycler® Nano)、Bio-Rad公司仪器(MiniOpticon™、CFX96 Touch™等)、BioFlux Line Gene等

不需要

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