单细胞微量RNA建库:GenNext® Shin-RamDA-seq® Single Cell Stranded Kit (Code No. RML-101, RML-101T)
面议

  Shin-RamDA-seq Kit包含文库制备试剂,可以支持从cDNA合成到测序的全过程。


  本试剂盒,适用于从单细胞微量RNA ・全长 RNA 、分解 RNA 及lncRNA等各种 RNA中合成 cDNA,可分析基因的方向性( 包含细胞裂解、基因组去除、RT 组分、 cDNA二链合成、片段化酶末端修复及连接等组分)

【关键词】

・Single cell (单细胞 )、 微量 RNA

・SMARTer , SMART-seq seq← 以往技术

・10X Genomics← 从细胞分离 到NGS 文库制备的自动化系统

【诉求点】

・ 可分析 non -poly poly(A )RNA ,也可分析无 poly(A) 的ncRNA,还能分析已被解失去 poly(A)的RNA

・检出基因数量多 ,可检测到迄今为止 少见 的基因

・可以分析骨骼 、胚胎 、神经细胞等 、神经细胞等 、神经细胞等 无法通过 10X解析的大细胞样品 解析的大细胞样品

・使用 scRNAseq了解作用机制并确认药物效果→可以在单细胞 水平上分析剪接变异


本试剂盒的特点

  1.可从单个细胞或微量RNA 中制备cDNA,可以使用1~100 个细胞或者10pg~1ng total RNA 作为起始模板。

  2.可对整个RNA 长度进行分析,可制备出能覆盖10kb 以上目的RNA 的全长cDNA

  3.能够检测各种类型的RNA,与传统技术相比,检测到的基因数量更多,除Poly(A) RNA 外,还可用于分析其他各类RNA

◇同源异构体及选择性剪接的识别

◇poly(A) RNA 及non-poly(A) RNA (组蛋白RNA 及lncRNA)的检测

◇核RNA(pre-mRNA 及lncRNA)的检测

  4.可支持文库制备(需要单独的接头),本试剂盒可用于Illumina NGS 中的文库制备。(需单独购买纯化磁珠,如 Agencourt® AMPure® XP 试剂(Beckman Coulter)和接头试剂盒,如TruSeq® DNA Single Indexes(Illumina))

  5、增强了链特异性

产品组成

  本试剂盒包含以下试剂,请在-20℃条件下保存。

GenNext® Shin-RamDA-seq® Single Cell Stranded Kit (Code: RML-101, RML-101T)

试剂名称      保存      规格(RML-101) 规格(RML-101T)

①Lysis Buffer   -20℃   240 μL 60 μL

②Lysis Enhancer   -20℃   240 μL 60 μL

③RNase Inhibitor   -20℃   22 μL 6 μL

④Nuclease free water   -20℃   960 μL 240 μL

⑤RT-RamDA® Buffer   -20℃   240 μL 60 μL

⑥gDNA Remover   -20℃   54 μL 14 μL

⑦rRNA Remover   -20℃   30 μL 8 μL

⑧RT-RamDA® Enzyme Mix   -20℃   54 μL 14 μL

⑨RT-RamDA® Primer Mix   -20℃   54 μL 14 μL

⑩2nd strand synthesis Buffer   -20℃   330 μL 83 μL

⑪2nd strand synthesis Enzyme   -20℃   55 μL 14 μL

⑫2nd strand synthesis Primer Mix   -20℃   275 μL 69 μL

⑬Fragmentase   -20℃   120 μL 30 μL

⑭End Repair and A-tailing Buffer   -20℃   96 μL 24 μL

⑮End Repair and A-tailing Enzyme   -20℃   24 μL 6 μL

⑯Ligation Solution   -20℃   480 μL 120 μL

⑰Library Amplification Master Mix   -20℃   300 μL 75 μL

⑱Library Amplification Primer Mix   -20℃   120 μL 30 μL


注意:本试剂盒中包含的所有试剂均为研究用试剂,切勿将其作为诊断或临床用试剂使用。在使用本试剂盒时,请严格遵守实验室一般注意事项,安全操作。

福建省,请联系:陈 173-5921-6592,林 159-8085-5879


参考文献

(1) Hayashi T., et al. Single-cell full-length total RNA sequencing uncovers dynamics of recursive splicing and enhancer RNAs. Nature Communications. 9:619 (2018)

(2) Ozaki H., et al. Millefy: visualizing cell-to-cell heterogeneity in read coverage of single-cell RNA sequencing datasets. BMC Genomics 21:177 (2020)

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